Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EP400Q96L91 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EP400Q96L91 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EP400Q96L91 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms