Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170P1Q96L14 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP170P1Q96L14 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170P1Q96L14 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170P1Q96L14 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170P1Q96L14 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170P1Q96L14 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170P1Q96L14 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms