Protein–RNA interactions for Protein: Q96J86

CYYR1, Cysteine and tyrosine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYYR1Q96J86 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYYR1Q96J86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYYR1Q96J86 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms