Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYFIP2Q96F07 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYFIP2Q96F07 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYFIP2Q96F07 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms