Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF3C6Q969F1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C6Q969F1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF3C6Q969F1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms