Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RAD50Q92878 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD50Q92878 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms