Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPATA4Q8NEY3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA4Q8NEY3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA4Q8NEY3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms