Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APPL2Q8NEU8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APPL2Q8NEU8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APPL2Q8NEU8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms