Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RDH13Q8NBN7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RDH13Q8NBN7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RDH13Q8NBN7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms