Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLX4Q8IY92 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLX4Q8IY92 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLX4Q8IY92 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLX4Q8IY92 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLX4Q8IY92 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLX4Q8IY92 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLX4Q8IY92 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLX4Q8IY92 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLX4Q8IY92 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms