Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZD3Q86UT5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD3Q86UT5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms