Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00523Q86TU6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms