Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4DQ86TL0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATG4DQ86TL0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATG4DQ86TL0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 341.8 ms