Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX6Q7RTT6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSX6Q7RTT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms