Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP2Q7RTS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP2Q7RTS6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP2Q7RTS6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms