Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS12Q6ZW61 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS12Q6ZW61 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BBS12Q6ZW61 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms