Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC141Q6ZP82 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC141Q6ZP82 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCDC141Q6ZP82 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms