Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNE3Q6ZMZ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNE3Q6ZMZ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms