Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LBX2Q6XYB7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LBX2Q6XYB7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LBX2Q6XYB7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms