Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CASC1Q6TDU7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CASC1Q6TDU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASC1Q6TDU7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms