Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM88Q6PEY1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms