Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKN3Q6P5Z2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms