Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RGMBQ6NW40 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RGMBQ6NW40 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGMBQ6NW40 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms