Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DENND4CQ5VZ89 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND4CQ5VZ89 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms