Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCERG1LQ5VWI1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms