Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRAMEF5Q5TYX0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRAMEF5Q5TYX0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms