Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAP1Q5SW96 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms