Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms