Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL22Q53GT1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL22Q53GT1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms