Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTDC1Q4AE62 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTDC1Q4AE62 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms