Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBR1Q16650 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBR1Q16650 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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