Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPE65Q16518 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPE65Q16518 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPE65Q16518 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms