Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1EQ15878 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1EQ15878 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms