Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE3CQ15386 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3CQ15386 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3CQ15386 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms