Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KARSQ15046 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KARSQ15046 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KARSQ15046 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KARSQ15046 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KARSQ15046 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KARSQ15046 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KARSQ15046 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KARSQ15046 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KARSQ15046 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KARSQ15046 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KARSQ15046 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KARSQ15046 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KARSQ15046 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KARSQ15046 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KARSQ15046 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KARSQ15046 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KARSQ15046 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KARSQ15046 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KARSQ15046 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KARSQ15046 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KARSQ15046 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KARSQ15046 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KARSQ15046 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KARSQ15046 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KARSQ15046 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KARSQ15046 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KARSQ15046 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KARSQ15046 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms