Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN5AQ14524 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN5AQ14524 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN5AQ14524 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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