Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIDRQ14159 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIDRQ14159 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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