Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFAIP1Q13829 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFAIP1Q13829 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFAIP1Q13829 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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