Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHAF1BQ13112 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1BQ13112 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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