Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM32Q13049 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM32Q13049 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM32Q13049 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms