Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms