Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YJR028WYJR028W 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YAR010CYAR010C 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YML040WYML040W 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YML045W-AYML045W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YMR051CYMR051C 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 DAL7YIR031C 1665 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 TOS4YLR183C 1470 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YCR015CYCR015C 954 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 BMH2YDR099W 822 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 YGL082WYGL082W 1146 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 CDC11YJR076C 1248 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 NFU1YKL040C 771 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 UIP3YAR027W 708 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 DPH5YLR172C 903 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 SFH1YLR321C 1281 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 RIF2YLR453C 1188 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 FIT2YOR382W 462 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-NL1Q12391 DEG1YFL001W 1329 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 COX10YPL172C 1389 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 CEF1YMR213W 1773 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YMR027WYMR027W 1413 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YJL163CYJL163C 1668 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 PET100YDR079W 336 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 RRP8YDR083W 1179 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 CTH1YDR151C 978 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YGR079WYGR079W 1113 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 BUD32YGR262C 786 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 ICS3YJL077C 396 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 STE18YJR086W 333 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YJR146WYJR146W 354 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 RLP24YLR009W 600 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 MRPL22YNL177C 930 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 RKI1YOR095C 777 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 ALG14YBR070C 714 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 RAD57YDR004W 1383 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 MIX14YDR031W 366 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 HSP42YDR171W 1128 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 PDE1YGL248W 1110 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 TIM21YGR033C 720 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 NQM1YGR043C 1002 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 AIM24YJR080C 1185 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YLR257WYLR257W 966 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YNL046WYNL046W 519 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YNL092WYNL092W 1203 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 HSH49YOR319W 642 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 TYE7YOR344C 876 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 CAR1YPL111W 1002 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YPL257WYPL257W 582 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 RPT2YDL007W 1314 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 SPT14YPL175W 1359 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 FRE7YOL152W 1863 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 VCX1YDL128W 1236 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 NPY1YGL067W 1155 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 BUD20YLR074C 501 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 MAP1YLR244C 1164 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 KAR4YCL055W 1008 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 VMA2YBR127C 1554 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 AI4Q0065 1671 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 SKI2YLR398C 3864 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 PYK2YOR347C 1521 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 MFG1YDL233W 1377 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 RNY1YPL123C 1305 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 VPS61YDR136C 573 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 DMA1YHR115C 1251 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 CIS3YJL158C 684 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 TPK1YJL164C 1194 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 COS9YKL219W 1224 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YLR374CYLR374C 390 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YBL094CYBL094C 333 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 BUD17YNR027W 954 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 COQ3YOL096C 939 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 ARF3YOR094W 552 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 TPO3YPR156C 1869 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 MIG1YGL035C 1515 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 RAP1YNL216W 2484 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 GEF1YJR040W 2340 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YTM1YOR272W 1383 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 RDI1YDL135C 609 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 snR84snR84 550 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 SRB7YDR308C 423 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YJL114WYJL114W 681 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 VPS25YJR102C 609 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YKL077WYKL077W 1179 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YMR084WYMR084W 789 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 IZH2YOL002C 954 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 IMA5YJL216C 1746 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 NSE5YML023C 1671 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 SER3YER081W 1410 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL1Q12391 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt5.84□□□□□ -1.47
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