Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 MRP21YBL090W 534 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 APC4YDR118W 1959 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 KCC4YCL024W 3114 nt4.87□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 VPS36YLR417W 1701 nt4.86□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SYP1YCR030C 2613 nt4.86□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YNL143CYNL143C 393 nt4.86□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 AIF1YNR074C 1137 nt4.86□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YPL073CYPL073C 486 nt4.86□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.86□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YHR177WYHR177W 1362 nt4.86□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 ESF1YDR365C 1887 nt4.86□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YMR196WYMR196W 3267 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SEG2YKL105C 3399 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 AUA1YFL010W-A 285 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YKL023WYKL023W 834 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YKR075CYKR075C 924 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SAP30YMR263W 606 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 CDC28YBR160W 897 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YCL012CYCL012C 405 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 RVB1YDR190C 1392 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 DNF2YDR093W 4839 nt4.85□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 LEU1YGL009C 2340 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 ALD3YMR169C 1521 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 ALD2YMR170C 1521 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 TFC7YOR110W 1308 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 TRM8YDL201W 861 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 GCV1YDR019C 1203 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 SUT1YGL162W 900 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YLR036CYLR036C 612 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 RPS0BYLR048W 759 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 YLR124WYLR124W 345 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 PRM9YAR031W 897 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 CCS1YMR038C 750 nt4.84□□□□□ -1.63
VPS54Q12071 RTC5YOR118W 1704 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 LDB17YDL146W 1476 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 FKH1YIL131C 1455 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 UBC1YDR177W 648 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 PAD1YDR538W 729 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 RCL1YOL010W 1104 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 GSP2YOR185C 663 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 ISA2YPR067W 558 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 UMP1YBR173C 447 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 FRS1YLR060W 1788 nt4.83□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 RKM2YDR198C 1440 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 TUB3YML124C 1338 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 ARF2YDL137W 546 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 ACT1YFL039C 1128 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YNL134CYNL134C 1131 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 CDC21YOR074C 915 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 OAZ1YPL052W 879 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YPL071CYPL071C 471 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 snR17bsnR17b 332 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 MAG2YLR427W 2013 nt4.82□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 SSB2YNL209W 1842 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 RAD57YDR004W 1383 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 DCD1YHR144C 939 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 NAT5YOR253W 531 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 MAK3YPR051W 531 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 SRB6YBR253W 366 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 SAF1YBR280C 1914 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 SFI1YLL003W 2841 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 MPH2YDL247W 1830 nt4.81□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 HUL4YJR036C 2679 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 THI22YPR121W 1719 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YJL206CYJL206C 2277 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 EKI1YDR147W 1605 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YEH2YLR020C 1617 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 AXL2YIL140W 2472 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 MRPL7YDR237W 879 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 PCT1YGR202C 1275 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 TEF4YKL081W 1239 nt4.8□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 MST1YKL194C 1389 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 PFA5YDR459C 1125 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 TYW3YGL050W 822 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YGR066CYGR066C 879 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YLL017WYLL017W 312 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 ABF1YKL112W 2196 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 SKG3YLR187W 3081 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 PEX29YDR479C 1665 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 PCA1YBR295W 3651 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 GPR1YDL035C 2886 nt4.79□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 EMP46YLR080W 1335 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 CBF5YLR175W 1452 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YDL012CYDL012C 324 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 KIN28YDL108W 921 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 YGP1YNL160W 1065 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 MAP2YBL091C 1266 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 KGD1YIL125W 3045 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 ECM32YER176W 3366 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 TDA6YPR157W 1404 nt4.78□□□□□ -1.64
VPS54Q12071 PGM2YMR105C 1710 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 TDA11YHR159W 1515 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 RCK2YLR248W 1833 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 BUR6YER159C 429 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 PSR1YLL010C 1284 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 YET2YMR040W 483 nt4.77□□□□□ -1.65
VPS54Q12071 CIN5YOR028C 888 nt4.77□□□□□ -1.65
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