Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAGPQ0VAQ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAGPQ0VAQ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms