Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RASGEF1BQ0VAM2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms