Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms