Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL18Q07020 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms