Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	DAM1	YGR113W	1032 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YMR085W	YMR085W	1299 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	PDX3	YBR035C	687 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	SPO19	YPL130W	672 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	ECM7	YLR443W	1347 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	ALD3	YMR169C	1521 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	ALD2	YMR170C	1521 nt		3.65	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YOL153C	YOL153C	1746 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	HIS4	YCL030C	2400 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	MNN1	YER001W	2289 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YDL027C	YDL027C	1263 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	GLE2	YER107C	1098 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	SKI6	YGR195W	741 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YIL165C	YIL165C	360 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	PBN1	YCL052C	1251 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	SBE2	YDR351W	2595 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	MAG2	YLR427W	2013 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	TRF5	YNL299W	1929 nt		3.64	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	BRE4	YDL231C	3378 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	FAR10	YLR238W	1437 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YDL094C	YDL094C	510 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	SRG1	SRG1	551 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	THI13	YDL244W	1023 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YIL171W	YIL171W	330 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	LOH1	YJL038C	660 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	THI11	YJR156C	1023 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	NTR2	YKR022C	969 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	AVO2	YMR068W	1281 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	ARG8	YOL140W	1272 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	NHX1	YDR456W	1902 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	EMP47	YFL048C	1338 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	LAS21	YJL062W	2493 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	TEL1	YBL088C	8364 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	LPL1	YOR059C	1353 nt		3.63	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	MIS1	YBR084W	2928 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	NOP8	YOL144W	1455 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	RRN11	YML043C	1524 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	BIO2	YGR286C	1128 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	CUZ1	YNL155W	825 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	BUD8	YLR353W	1812 nt		3.62	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	MDM30	YLR368W	1797 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	HOM3	YER052C	1584 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	GCV1	YDR019C	1203 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	RPL24A	YGL031C	468 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	SOL4	YGR248W	768 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YHR214W	YHR214W	612 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	ERG3	YLR056W	1098 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YAR066W	YAR066W	612 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YMR315W	YMR315W	1050 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YIF1	YNL263C	945 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	PFK1	YGR240C	2964 nt		3.61	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YND1	YER005W	1893 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	NUG1	YER006W	1563 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	COQ4	YDR204W	1008 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	RAD27	YKL113C	1149 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	NMA1	YLR328W	1206 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	STB2	YMR053C	2553 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	NOP58	YOR310C	1536 nt		3.6	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	KCC4	YCL024W	3114 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	DCV1	YFR012W	609 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YPL077C	YPL077C	723 nt		3.59	□□□□□ -1.83
YMR090W	Q04304	YIL001W	YIL001W	1542 nt		3.59	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	LAS1	YKR063C	1509 nt		3.59	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	ADP1	YCR011C	3150 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	PRE9	YGR135W	777 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	RPL8A	YHL033C	771 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	ECM1	YAL059W	639 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	MAP1	YLR244C	1164 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	FEX1	YOR390W	1128 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	FEX2	YPL279C	1128 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YCL022C	YCL022C	516 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	RAD1	YPL022W	3303 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	THI7	YLR237W	1797 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	JHD2	YJR119C	2187 nt		3.58	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	IRC7	YFR055W	1023 nt		3.57	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YLR283W	YLR283W	945 nt		3.57	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	PRM1	YNL279W	1986 nt		3.57	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YLH47	YPR125W	1365 nt		3.57	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	SRB6	YBR253W	366 nt		3.57	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YNL247W	YNL247W	2304 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	MKS1	YNL076W	1755 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YPL277C	YPL277C	1464 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	SSH1	YBR283C	1473 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	VID30	YGL227W	2877 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	SLD2	YKL108W	1362 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	RTC1	YOL138C	4026 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	ARC1	YGL105W	1131 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	NVJ1	YHR195W	966 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YJU2	YKL095W	837 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	RMA1	YKL132C	1293 nt		3.56	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms