Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 YJR015WYJR015W 1533 nt5.43□□□□□ -1.54
SND1Q04007 NOB1YOR056C 1380 nt5.43□□□□□ -1.54
SND1Q04007 FRS1YLR060W 1788 nt5.43□□□□□ -1.54
SND1Q04007 GCS1YDL226C 1059 nt5.43□□□□□ -1.54
SND1Q04007 MAF1YDR005C 1188 nt5.43□□□□□ -1.54
SND1Q04007 RER2YBR002C 861 nt5.43□□□□□ -1.54
SND1Q04007 IRC14YOR135C 342 nt5.43□□□□□ -1.54
SND1Q04007 RPT2YDL007W 1314 nt5.43□□□□□ -1.54
SND1Q04007 TRM13YOL125W 1431 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 PTC1YDL006W 846 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YDL012CYDL012C 324 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 snR78snR78 87 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 POP6YGR030C 477 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YJL068CYJL068C 900 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 ERI1YPL096C-A 207 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 PMT4YJR143C 2289 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 NPL4YBR170C 1743 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 ZUO1YGR285C 1302 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 HAP1YLR256W 4509 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 TYR1YBR166C 1359 nt5.42□□□□□ -1.54
SND1Q04007 NQM1YGR043C 1002 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YGR219WYGR219W 342 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YBL036CYBL036C 774 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 SSP2YOR242C 1116 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 BBP1YPL255W 1158 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 STE50YCL032W 1041 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YCL041CYCL041C 495 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 FOL1YNL256W 2475 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 ASF2YDL197C 1578 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 TRE1YPL176C 2352 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 KCC4YCL024W 3114 nt5.41□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YAP1YML007W 1953 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 SOF1YLL011W 1470 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 MNN2YBR015C 1794 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 TDA11YHR159W 1515 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 AIR2YDL175C 1035 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YDR336WYDR336W 945 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 RAD10YML095C 633 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YMR178WYMR178W 825 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YMR315WYMR315W 1050 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 YNR061CYNR061C 660 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 MRM1YOR201C 1239 nt5.4□□□□□ -1.54
SND1Q04007 HIS4YCL030C 2400 nt5.4□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ECM32YER176W 3366 nt5.4□□□□□ -1.55
SND1Q04007 HMS1YOR032C 1305 nt5.4□□□□□ -1.55
SND1Q04007 CLB5YPR120C 1308 nt5.4□□□□□ -1.55
SND1Q04007 SKM1YOL113W 1968 nt5.4□□□□□ -1.55
SND1Q04007 QDR1YIL120W 1692 nt5.4□□□□□ -1.55
SND1Q04007 RKM2YDR198C 1440 nt5.4□□□□□ -1.55
SND1Q04007 DAK1YML070W 1755 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 KIP2YPL155C 2121 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 NGL3YML118W 1518 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 SSZ1YHR064C 1617 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 CLN2YPL256C 1638 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YGL185CYGL185C 1140 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 MRP13YGR084C 1020 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 SPG4YMR107W 348 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YNL134CYNL134C 1131 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 LEM3YNL323W 1245 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YOL166CYOL166C 339 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 SEC39YLR440C 2130 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 BRF1YGR246C 1791 nt5.39□□□□□ -1.55
SND1Q04007 PRP19YLL036C 1512 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 GPB1YOR371C 2694 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YPT32YGL210W 669 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 RPC17YJL011C 486 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YKR041WYKR041W 753 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 UPS2YLR168C 693 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 CTL1YMR180C 963 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ALD3YMR169C 1521 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ALD2YMR170C 1521 nt5.38□□□□□ -1.55
SND1Q04007 NUP42YDR192C 1293 nt5.37□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YGL193CYGL193C 312 nt5.37□□□□□ -1.55
SND1Q04007 MRPS35YGR165W 1038 nt5.37□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ERG3YLR056W 1098 nt5.37□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ETR1YBR026C 1143 nt5.37□□□□□ -1.55
SND1Q04007 THI21YPL258C 1656 nt5.37□□□□□ -1.55
SND1Q04007 TYW1YPL207W 2433 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 VID30YGL227W 2877 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YCR050CYCR050C 309 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 MSS2YDL107W 1056 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 PRM10YJL108C 1152 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 MTW1YAL034W-A 870 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 LAC1YKL008C 1257 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 TFA2YKR062W 987 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YLR125WYLR125W 411 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 ELO3YLR372W 1038 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YLR462WYLR462W 609 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 HEK2YBL032W 1146 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YMR084WYMR084W 789 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 AIM39YOL053W 1188 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 VPS68YOL129W 555 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 MMT1YMR177W 1533 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 YIR007WYIR007W 2295 nt5.36□□□□□ -1.55
SND1Q04007 SLT2YHR030C 1455 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 RRP14YKL082C 1305 nt5.35□□□□□ -1.55
SND1Q04007 DAS2YDR020C 699 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.6 ms