Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A2Q01362 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A2Q01362 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A2Q01362 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A2Q01362 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A2Q01362 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MS4A2Q01362 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.7 ms